Protein–RNA interactions for Protein: O08584

Klf6, Krueppel-like factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf6O08584 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klf6O08584 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klf6O08584 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klf6O08584 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klf6O08584 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klf6O08584 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klf6O08584 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klf6O08584 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Klf6O08584 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Klf6O08584 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Klf6O08584 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Klf6O08584 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Klf6O08584 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Klf6O08584 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klf6O08584 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf6O08584 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf6O08584 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf6O08584 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klf6O08584 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms