Protein–RNA interactions for Protein: O08542

Efna4, Ephrin-A4, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna4O08542 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Efna4O08542 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efna4O08542 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna4O08542 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efna4O08542 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efna4O08542 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efna4O08542 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efna4O08542 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efna4O08542 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efna4O08542 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms