Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Gm5225J3QPL3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Gm5225J3QPL3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5225J3QPL3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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