Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms