Protein–RNA interactions for Protein: J3QJX6

7530416G11Rik, RIKEN cDNA 7530416G11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
7530416G11RikJ3QJX6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
7530416G11RikJ3QJX6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms