Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm21818J3KMS6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm21818J3KMS6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms