Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Arfgef1G3X9K3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Arfgef1G3X9K3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms