Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34aG3UW52 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34aG3UW52 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34aG3UW52 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34aG3UW52 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34aG3UW52 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34aG3UW52 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34aG3UW52 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34aG3UW52 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34aG3UW52 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34aG3UW52 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34aG3UW52 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34aG3UW52 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34aG3UW52 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34aG3UW52 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34aG3UW52 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34aG3UW52 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34aG3UW52 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms