Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Srp72F8VQC1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms