Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC8.4□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Gm20538F6Z9R1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms