Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8247F6VRJ8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8247F6VRJ8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8247F6VRJ8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8247F6VRJ8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8247F6VRJ8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8247F6VRJ8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8247F6VRJ8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8247F6VRJ8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8247F6VRJ8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8247F6VRJ8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8247F6VRJ8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8247F6VRJ8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8247F6VRJ8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8247F6VRJ8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8247F6VRJ8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8247F6VRJ8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8247F6VRJ8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8247F6VRJ8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms