Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3Y9

2610001J05Rik, RIKEN cDNA 2610001J05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610001J05RikF2Z3Y9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
2610001J05RikF2Z3Y9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms