Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc74aE9Q9U8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc74aE9Q9U8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms