Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdh16f1E9Q9P8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rdh16f1E9Q9P8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh16f1E9Q9P8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh16f1E9Q9P8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh16f1E9Q9P8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh16f1E9Q9P8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh16f1E9Q9P8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh16f1E9Q9P8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh16f1E9Q9P8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh16f1E9Q9P8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh16f1E9Q9P8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh16f1E9Q9P8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh16f1E9Q9P8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh16f1E9Q9P8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh16f1E9Q9P8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh16f1E9Q9P8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh16f1E9Q9P8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh16f1E9Q9P8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh16f1E9Q9P8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh16f1E9Q9P8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh16f1E9Q9P8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms