Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6R1

Itga10, Integrin, alpha 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga10E9Q6R1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itga10E9Q6R1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Itga10E9Q6R1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itga10E9Q6R1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itga10E9Q6R1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itga10E9Q6R1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itga10E9Q6R1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms