Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc71lE9Q4T4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc71lE9Q4T4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc71lE9Q4T4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc71lE9Q4T4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc71lE9Q4T4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc71lE9Q4T4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc71lE9Q4T4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc71lE9Q4T4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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