Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ddx60E9PZQ1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ddx60E9PZQ1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ddx60E9PZQ1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ddx60E9PZQ1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ddx60E9PZQ1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ddx60E9PZQ1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ddx60E9PZQ1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddx60E9PZQ1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddx60E9PZQ1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddx60E9PZQ1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddx60E9PZQ1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddx60E9PZQ1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddx60E9PZQ1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddx60E9PZQ1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddx60E9PZQ1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddx60E9PZQ1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddx60E9PZQ1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddx60E9PZQ1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddx60E9PZQ1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddx60E9PZQ1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddx60E9PZQ1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddx60E9PZQ1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddx60E9PZQ1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddx60E9PZQ1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddx60E9PZQ1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddx60E9PZQ1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddx60E9PZQ1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddx60E9PZQ1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddx60E9PZQ1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddx60E9PZQ1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddx60E9PZQ1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddx60E9PZQ1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ddx60E9PZQ1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms