Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rdh8D3Z6W3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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