Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccnb1ip1D3Z3K2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms