Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cspp1B2RX88 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms