Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rd3lB2RV38 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms