Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zscan5bB2RTN3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms