Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rrn3B2RS91 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rrn3B2RS91 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rrn3B2RS91 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rrn3B2RS91 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rrn3B2RS91 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rrn3B2RS91 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rrn3B2RS91 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rrn3B2RS91 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rrn3B2RS91 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rrn3B2RS91 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rrn3B2RS91 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rrn3B2RS91 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rrn3B2RS91 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rrn3B2RS91 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rrn3B2RS91 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rrn3B2RS91 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rrn3B2RS91 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rrn3B2RS91 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rrn3B2RS91 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rrn3B2RS91 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rrn3B2RS91 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rrn3B2RS91 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rrn3B2RS91 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rrn3B2RS91 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rrn3B2RS91 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rrn3B2RS91 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rrn3B2RS91 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rrn3B2RS91 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rrn3B2RS91 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rrn3B2RS91 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rrn3B2RS91 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rrn3B2RS91 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rrn3B2RS91 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rrn3B2RS91 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rrn3B2RS91 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rrn3B2RS91 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rrn3B2RS91 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rrn3B2RS91 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rrn3B2RS91 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrn3B2RS91 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrn3B2RS91 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrn3B2RS91 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrn3B2RS91 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrn3B2RS91 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrn3B2RS91 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrn3B2RS91 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrn3B2RS91 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrn3B2RS91 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrn3B2RS91 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrn3B2RS91 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrn3B2RS91 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrn3B2RS91 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rrn3B2RS91 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rrn3B2RS91 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rrn3B2RS91 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rrn3B2RS91 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rrn3B2RS91 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rrn3B2RS91 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rrn3B2RS91 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rrn3B2RS91 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rrn3B2RS91 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rrn3B2RS91 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rrn3B2RS91 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rrn3B2RS91 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rrn3B2RS91 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rrn3B2RS91 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rrn3B2RS91 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rrn3B2RS91 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rrn3B2RS91 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrn3B2RS91 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrn3B2RS91 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrn3B2RS91 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrn3B2RS91 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrn3B2RS91 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrn3B2RS91 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrn3B2RS91 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrn3B2RS91 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrn3B2RS91 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrn3B2RS91 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrn3B2RS91 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrn3B2RS91 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrn3B2RS91 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrn3B2RS91 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrn3B2RS91 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrn3B2RS91 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrn3B2RS91 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrn3B2RS91 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrn3B2RS91 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrn3B2RS91 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrn3B2RS91 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrn3B2RS91 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrn3B2RS91 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrn3B2RS91 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrn3B2RS91 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrn3B2RS91 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrn3B2RS91 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrn3B2RS91 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrn3B2RS91 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrn3B2RS91 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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