Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Otud4B2RRE7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Otud4B2RRE7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms