Protein–RNA interactions for Protein: B1APN4

Rhox1, Reproductive homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox1B1APN4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhox1B1APN4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms