Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ccdc9bA3KGF9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc9bA3KGF9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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