Protein–RNA interactions for Protein: A2RSJ4

Uhrf1bp1l, UHRF1-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms