Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Syndig1A2ANU3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms