Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SetxA2AKX3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms