Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc183A2AJB1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc183A2AJB1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms