Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pkd2l1A2A259 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pkd2l1A2A259 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pkd2l1A2A259 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pkd2l1A2A259 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkd2l1A2A259 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkd2l1A2A259 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkd2l1A2A259 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkd2l1A2A259 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkd2l1A2A259 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkd2l1A2A259 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkd2l1A2A259 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkd2l1A2A259 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkd2l1A2A259 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkd2l1A2A259 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkd2l1A2A259 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkd2l1A2A259 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkd2l1A2A259 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkd2l1A2A259 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkd2l1A2A259 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkd2l1A2A259 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkd2l1A2A259 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkd2l1A2A259 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkd2l1A2A259 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkd2l1A2A259 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkd2l1A2A259 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pkd2l1A2A259 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pkd2l1A2A259 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms