Protein–RNA interactions for Protein: A1Y9I9

Tomt, Transmembrane O-methyltransferase homolog, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TomtA1Y9I9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TomtA1Y9I9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms