Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc173A0JLY1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms