Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P8

Trbv13-1, T cell receptor beta, variable 13-1 (Fragment), mousemouse

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Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv13-1A0A0B4J1P8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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