Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P5

Trbv26, T cell receptor beta, variable 26 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv26A0A0B4J1P5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Trbv26A0A0B4J1P5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Trbv26A0A0B4J1P5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Trbv26A0A0B4J1P5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv26A0A0B4J1P5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trbv26A0A0B4J1P5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trbv26A0A0B4J1P5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv26A0A0B4J1P5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv26A0A0B4J1P5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv26A0A0B4J1P5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv26A0A0B4J1P5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv26A0A0B4J1P5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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