Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P1

Trbv30, T cell receptor beta, variable 30 (Fragment), mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv30A0A0B4J1P1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv30A0A0B4J1P1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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