Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H1

Trbv12-2, T cell receptor beta, variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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