Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Rpl29-ps2-202ENSMUST00000220540 1165 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Rpl21-ps6-201ENSMUST00000074828 468 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 mt-Cytb-201ENSMUST00000082421 1144 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Olfr1407-ps1-201ENSMUST00000085885 797 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Olfr570-201ENSMUST00000098215 1045 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Glrx2-204ENSMUST00000129653 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Vmn1r45-204ENSMUST00000227426 3205 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Vmn1r218-203ENSMUST00000227050 10364 ntAPPRIS P2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Vmn1r71-206ENSMUST00000228098 7165 ntAPPRIS P2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Nusap1-202ENSMUST00000068225 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 AC124746.1-201ENSMUST00000227535 1300 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Pold3-209ENSMUST00000208670 1716 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Olfr823-202ENSMUST00000213145 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 F930017D23Rik-201ENSMUST00000099888 1836 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Vmn2r103-201ENSMUST00000172203 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Gm42507-201ENSMUST00000201187 2555 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 4921524L21Rik-201ENSMUST00000044829 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Rasef-201ENSMUST00000058292 5183 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 9230109A22Rik-202ENSMUST00000228644 1853 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Gm42721-201ENSMUST00000197165 1523 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Aspa-201ENSMUST00000021119 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Tmem45a2-201ENSMUST00000067173 3073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Myo1b-204ENSMUST00000114541 4616 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Kmt2d-202ENSMUST00000178486 19805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Bclaf1-203ENSMUST00000185800 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Pls3-202ENSMUST00000114057 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Cd44-203ENSMUST00000099673 2848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Olfr329-ps-203ENSMUST00000219448 4052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Olfr178-202ENSMUST00000206523 2095 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Olfr1299-201ENSMUST00000207228 1678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Gm23739-201ENSMUST00000102295 108 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Trav6-6-201ENSMUST00000103584 344 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Gm13114-201ENSMUST00000117605 106 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Gm15390-201ENSMUST00000120323 738 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Gm14925-201ENSMUST00000120611 438 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Gm15522-201ENSMUST00000134467 785 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Gm11731-201ENSMUST00000139704 670 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Olfr367-ps-202ENSMUST00000143957 942 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Gm22794-201ENSMUST00000157228 306 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Gm23034-201ENSMUST00000158001 147 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Gm24733-201ENSMUST00000158863 253 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Gm16557-201ENSMUST00000159182 191 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Vmn1r-ps20-201ENSMUST00000176809 915 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Gm20643-201ENSMUST00000177284 322 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 1600029O15Rik-201ENSMUST00000178259 517 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Gm23450-201ENSMUST00000178285 91 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Trav6d-7-201ENSMUST00000178650 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 AF067063-201ENSMUST00000179455 590 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Trav6n-7-201ENSMUST00000179607 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Mir6911-201ENSMUST00000184241 69 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Snhg14-205ENSMUST00000186345 456 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Gm29641-201ENSMUST00000188955 259 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Gm37784-201ENSMUST00000193233 189 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Gm7626-201ENSMUST00000195801 353 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Gm35013-201ENSMUST00000197218 832 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Gm43140-201ENSMUST00000197317 456 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Trav6d-6-201ENSMUST00000197754 344 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Gm42109-202ENSMUST00000200893 664 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Gm43227-201ENSMUST00000202239 677 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Gm18467-201ENSMUST00000208805 434 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Gm45554-203ENSMUST00000211410 2137 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Gm45473-201ENSMUST00000211452 616 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 AC117688.1-201ENSMUST00000213142 832 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 CT009748.2-201ENSMUST00000213828 1082 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 1700048P04Rik-201ENSMUST00000219825 369 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 4930529N20Rik-201ENSMUST00000220538 639 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 AC154450.1-201ENSMUST00000220911 485 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 AV026068-216ENSMUST00000223874 328 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 AC159205.4-201ENSMUST00000225964 704 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 CT009515.3-201ENSMUST00000226509 671 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 AC150560.3-201ENSMUST00000227442 455 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 AC120375.2-202ENSMUST00000228722 397 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Scrg1-201ENSMUST00000034023 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Uqcrh-ps1-201ENSMUST00000038391 270 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Vmn1r184-201ENSMUST00000057123 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Mmp12-202ENSMUST00000065079 1185 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Tas2r124-201ENSMUST00000076150 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Gm25582-201ENSMUST00000083412 110 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Clec9a-202ENSMUST00000088075 1020 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Gm1966-201ENSMUST00000184540 7293 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RpainQ9CWY9 Ryr3-211ENSMUST00000208290 15468 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm8126-201ENSMUST00000169587 1764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Abcg3-202ENSMUST00000130644 2668 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm42600-201ENSMUST00000202081 3588 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Enox2-201ENSMUST00000033437 3170 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm8822-201ENSMUST00000118948 2347 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Fbxo3-202ENSMUST00000102565 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Naip2-201ENSMUST00000067975 4709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm44667-201ENSMUST00000207632 3337 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm5460-201ENSMUST00000100719 1903 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 AC151904.1-201ENSMUST00000219945 1498 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm11264-201ENSMUST00000143755 2969 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 4930533N22Rik-202ENSMUST00000206684 1503 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 D130004A15Rik-201ENSMUST00000201492 1577 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm40987-202ENSMUST00000221856 1588 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm43900-201ENSMUST00000204868 2669 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Gm5128-202ENSMUST00000180198 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
RpainQ9CWY9 Olfr430-202ENSMUST00000213425 3873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
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