Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Trav6-1-201ENSMUST00000103571 338 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Mir582-201ENSMUST00000103758 81 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Gm5943-201ENSMUST00000119458 459 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Gm11925-201ENSMUST00000121375 535 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Gm11734-201ENSMUST00000132261 728 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Gm7846-201ENSMUST00000145844 274 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Gm24216-201ENSMUST00000158259 117 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Gm25489-201ENSMUST00000158727 141 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Dab2-209ENSMUST00000161040 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Gm5929-201ENSMUST00000166883 487 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Lipo1-202ENSMUST00000178735 1188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Gm29554-201ENSMUST00000187922 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Gm28113-201ENSMUST00000188280 229 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Gm37308-201ENSMUST00000194684 100 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BcanQ61361 S100a14-203ENSMUST00000199538 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Gm42750-201ENSMUST00000199745 353 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Gm44410-201ENSMUST00000203151 341 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Gm8035-201ENSMUST00000204625 687 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Gm33601-201ENSMUST00000210001 961 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Gm45874-201ENSMUST00000212423 346 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Rab7-ps1-201ENSMUST00000213253 622 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Gm19137-201ENSMUST00000213790 1164 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BcanQ61361 AC153845.2-203ENSMUST00000215889 617 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Rpl17-ps2-201ENSMUST00000218101 532 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BcanQ61361 AC079644.1-201ENSMUST00000220586 405 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Gm46996-201ENSMUST00000220924 408 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BcanQ61361 AC158523.2-201ENSMUST00000222708 548 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Olfr1022-201ENSMUST00000054736 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Olfr447-201ENSMUST00000055763 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BcanQ61361 n-R5s204-201ENSMUST00000082972 119 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Sulf1-202ENSMUST00000177608 5598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Olfr1340-203ENSMUST00000216242 3341 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Tor1aip2-203ENSMUST00000097526 2589 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Gm13219-203ENSMUST00000154223 1843 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
BcanQ61361 AC108802.1-201ENSMUST00000219501 3142 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Chd6-201ENSMUST00000039782 10515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Dopey1-201ENSMUST00000034987 8933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Olfr441-202ENSMUST00000213649 2402 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BcanQ61361 AC121942.1-201ENSMUST00000224459 2891 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Cpxcr1-201ENSMUST00000101269 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Robo2-203ENSMUST00000117785 8124 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Gm45160-201ENSMUST00000207112 3099 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Nxt2-202ENSMUST00000112913 2538 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Vmn1r6-206ENSMUST00000227847 8073 ntAPPRIS P2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Bclaf1-203ENSMUST00000185800 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Traj16-201ENSMUST00000103725 61 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Prl-202ENSMUST00000110369 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Gm8858-201ENSMUST00000118259 342 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Gm3943-201ENSMUST00000118606 718 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Gm6121-201ENSMUST00000119231 924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Gm16423-201ENSMUST00000120078 947 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Gm14808-201ENSMUST00000129259 361 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
BcanQ61361 1700019G24Rik-201ENSMUST00000130004 503 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Gm11234-201ENSMUST00000141030 845 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
BcanQ61361 A930041C12Rik-201ENSMUST00000149156 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Gm25962-201ENSMUST00000157173 168 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Gm16558-201ENSMUST00000163015 532 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Pfdn5-208ENSMUST00000170627 330 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Arhgap39-209ENSMUST00000177026 371 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Gm26652-201ENSMUST00000180592 373 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Gm5946-201ENSMUST00000182340 970 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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BcanQ61361 Gm5268-201ENSMUST00000189212 940 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Gm6445-201ENSMUST00000189515 1112 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Gm28467-201ENSMUST00000190981 318 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Gm37073-201ENSMUST00000192469 1222 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Gm37958-201ENSMUST00000193131 430 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Rpl26-ps3-201ENSMUST00000195115 435 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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BcanQ61361 Gm44225-201ENSMUST00000203582 186 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Gm45883-201ENSMUST00000210131 853 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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BcanQ61361 Cwc15-202ENSMUST00000213913 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
BcanQ61361 AL603745.1-201ENSMUST00000215473 532 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
BcanQ61361 RMST_1.1-205ENSMUST00000218060 997 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
BcanQ61361 AC153800.1-201ENSMUST00000219212 365 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Gm3785-201ENSMUST00000221000 202 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
BcanQ61361 AC155305.1-201ENSMUST00000222207 319 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
BcanQ61361 AC168059.2-201ENSMUST00000224473 333 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Glycam1-203ENSMUST00000228060 528 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Pdcd10-201ENSMUST00000029424 907 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
BcanQ61361 4930504O13Rik-201ENSMUST00000064614 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Olfr441-201ENSMUST00000095954 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Defa-ps18-201ENSMUST00000098889 371 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Cyp2j5-201ENSMUST00000030299 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Gm30570-201ENSMUST00000213553 2651 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Gm30075-201ENSMUST00000205509 3005 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Gm42892-201ENSMUST00000196227 3973 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Rgs7-207ENSMUST00000195324 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Olfr1387-202ENSMUST00000214541 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Gm38377-201ENSMUST00000193253 3772 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Il18r1-202ENSMUST00000108044 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Gm44697-201ENSMUST00000207756 1679 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Serpinb3c-201ENSMUST00000027565 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Adam7-201ENSMUST00000022640 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
BcanQ61361 1700017N19Rik-207ENSMUST00000190708 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
BcanQ61361 Hspa13-202ENSMUST00000114244 2674 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.7 ms