Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm30075-201ENSMUST00000205509 3005 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm45843-201ENSMUST00000212317 4597 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Zc3h11a-204ENSMUST00000191896 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm9048-201ENSMUST00000177744 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm9040-201ENSMUST00000177762 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm9044-201ENSMUST00000179851 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm9046-201ENSMUST00000218329 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Otogl-201ENSMUST00000165341 8763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 4933406B17Rik-201ENSMUST00000212602 4333 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Cyb5r2-201ENSMUST00000052438 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 AC129308.2-203ENSMUST00000224109 2385 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Kcnj16-201ENSMUST00000106635 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 AC154406.1-201ENSMUST00000215220 2529 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 A730091E23Rik-201ENSMUST00000221700 3825 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Mc2r-201ENSMUST00000052347 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Ptprz1-206ENSMUST00000202579 6871 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Tmem167-203ENSMUST00000161568 8689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Scn1a-202ENSMUST00000094951 5946 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm34004-201ENSMUST00000215460 2837 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Mfap3-201ENSMUST00000020830 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Slc12a6-203ENSMUST00000110987 3722 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Atp8b5-202ENSMUST00000102953 2609 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Meis1-208ENSMUST00000177417 5308 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Olfr1474-203ENSMUST00000220113 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm45297-201ENSMUST00000209893 3483 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Cmah-208ENSMUST00000224819 9482 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Cd274-201ENSMUST00000016640 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Grik2-202ENSMUST00000105484 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm2987-201ENSMUST00000187673 1693 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Pcdh15-234ENSMUST00000191854 9104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Dopey1-218ENSMUST00000190957 9187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Qsox2-202ENSMUST00000091263 4011 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Agtr1b-202ENSMUST00000163776 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Mob1b-202ENSMUST00000113229 8967 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm12887-201ENSMUST00000106265 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm13983-201ENSMUST00000118018 865 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm12135-201ENSMUST00000119170 466 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm14796-201ENSMUST00000121216 959 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm13738-201ENSMUST00000122437 469 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Klra13-ps-201ENSMUST00000125813 802 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Defb44-ps-201ENSMUST00000126871 219 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm15503-201ENSMUST00000141541 449 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Mup-ps2-201ENSMUST00000142602 533 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 4930401O12Rik-201ENSMUST00000153175 841 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm25669-201ENSMUST00000157699 112 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm25335-201ENSMUST00000158043 103 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm22523-201ENSMUST00000158696 100 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Wfdc15b-203ENSMUST00000164567 497 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Rnf32-211ENSMUST00000168460 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Klrc1-204ENSMUST00000169545 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Ulbp1-201ENSMUST00000169796 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Crxos-205ENSMUST00000171280 571 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Obox4-ps29-201ENSMUST00000175956 1134 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 1700034J04Rik-201ENSMUST00000192736 750 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm19739-201ENSMUST00000195941 153 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm43459-201ENSMUST00000202093 331 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm43976-201ENSMUST00000203637 235 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm44687-201ENSMUST00000204975 235 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 AC079644.2-201ENSMUST00000220581 322 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gpx8-201ENSMUST00000022282 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 AC154271.1-201ENSMUST00000224780 383 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 CT009711.2-201ENSMUST00000225352 934 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Lalba-201ENSMUST00000023726 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Ccr1l1-201ENSMUST00000071404 1166 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
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Hoxd9P28357 Oxr1-207ENSMUST00000179393 4498 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm37423-201ENSMUST00000194246 3342 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Mtpap-201ENSMUST00000025077 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm42540-201ENSMUST00000200319 2008 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm26806-201ENSMUST00000180403 1519 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Sult1c2-201ENSMUST00000023886 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Psg16-202ENSMUST00000118367 2282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm17056-201ENSMUST00000164804 2299 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Utp14b-ps1-201ENSMUST00000197716 2265 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Ccr2-203ENSMUST00000168841 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Angptl1-202ENSMUST00000111720 1332 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Cyld-202ENSMUST00000098519 7954 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm13416-201ENSMUST00000117264 1612 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Itch-201ENSMUST00000029126 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Rprd2-201ENSMUST00000090791 7756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Ect2-203ENSMUST00000108300 4086 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm29017-201ENSMUST00000190598 2092 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Fbln5-203ENSMUST00000222587 2371 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Adipor2-201ENSMUST00000032272 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm23748-201ENSMUST00000104227 131 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Glrb-202ENSMUST00000107743 1101 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Kynu-203ENSMUST00000112826 1587 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Skil-203ENSMUST00000118204 2904 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm13349-201ENSMUST00000118436 411 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm12447-201ENSMUST00000119110 470 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm11352-201ENSMUST00000119264 517 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm15113-201ENSMUST00000119280 836 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm7363-201ENSMUST00000119883 399 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm15034-201ENSMUST00000120043 349 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm14613-201ENSMUST00000122239 752 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm16254-201ENSMUST00000131528 730 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd9P28357 Gm13838-201ENSMUST00000132130 531 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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