Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm22177-201ENSMUST00000175002 158 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm25748-201ENSMUST00000175487 70 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm29576-201ENSMUST00000188020 678 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm28354-201ENSMUST00000190904 678 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm37719-201ENSMUST00000194615 292 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm43580-201ENSMUST00000202892 284 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm44648-201ENSMUST00000208267 329 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm45857-201ENSMUST00000212207 356 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm5374-202ENSMUST00000222910 314 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 AC164618.1-201ENSMUST00000225769 592 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
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Col5a3Q9JLI2 Iapp-201ENSMUST00000041993 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Cntn6-201ENSMUST00000089215 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Olfr1300-ps1-201ENSMUST00000208175 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
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Col5a3Q9JLI2 Gm45179-201ENSMUST00000208452 4337 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Cntn4-202ENSMUST00000089208 5179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Tyr-201ENSMUST00000004770 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Ccl28-201ENSMUST00000099241 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Xpo7-203ENSMUST00000226448 3663 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
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Col5a3Q9JLI2 Mageb16-202ENSMUST00000114016 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Zbed4-ps2-201ENSMUST00000187003 3448 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Zfp763-201ENSMUST00000087654 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Trim23-202ENSMUST00000069174 4258 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Dnah17-203ENSMUST00000106308 14973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Pik3ca-202ENSMUST00000108242 6171 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Macc1-202ENSMUST00000221866 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
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Col5a3Q9JLI2 4932414N04Rik-204ENSMUST00000128259 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Nr1h5-201ENSMUST00000058899 2835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Pde1c-206ENSMUST00000166890 4728 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Olfr1353-201ENSMUST00000039718 1992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Smc5-206ENSMUST00000226111 3265 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm42819-201ENSMUST00000199630 5121 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm14831-201ENSMUST00000120253 409 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
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Col5a3Q9JLI2 Gm12735-201ENSMUST00000146218 651 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
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Col5a3Q9JLI2 BC028528-201ENSMUST00000036360 752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 2610303G11Rik-201ENSMUST00000061643 517 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 B3gnt5-201ENSMUST00000079780 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Samd12-201ENSMUST00000078673 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
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Col5a3Q9JLI2 Hapln1-201ENSMUST00000022108 5715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Olfr104-ps-201ENSMUST00000178766 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 AC102431.1-201ENSMUST00000223773 1449 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
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Col5a3Q9JLI2 Olfr390-204ENSMUST00000215161 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 2900079G21Rik-204ENSMUST00000163302 2764 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Utrn-201ENSMUST00000076817 12382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
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Col5a3Q9JLI2 Vmn2r32-201ENSMUST00000094866 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
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Col5a3Q9JLI2 Gm13815-201ENSMUST00000119963 412 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Kcne1-202ENSMUST00000166707 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm6155-201ENSMUST00000173735 341 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm27818-201ENSMUST00000184536 159 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm28859-201ENSMUST00000186650 616 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
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Col5a3Q9JLI2 Gm9317-201ENSMUST00000197055 862 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm11360-201ENSMUST00000221898 262 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Klhl24-201ENSMUST00000023509 6683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
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Col5a3Q9JLI2 Mtm1-213ENSMUST00000171933 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Ccnb2-ps-202ENSMUST00000170898 2296 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm5039-202ENSMUST00000218054 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
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Col5a3Q9JLI2 Ankrd49-202ENSMUST00000214456 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Cdh10-202ENSMUST00000166873 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Dock10-209ENSMUST00000190983 6672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm2539-201ENSMUST00000180720 2411 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm11484-201ENSMUST00000119808 338 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
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Col5a3Q9JLI2 Gm26362-201ENSMUST00000158865 315 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm28703-201ENSMUST00000185312 1159 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm29196-201ENSMUST00000189239 618 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm37167-201ENSMUST00000194946 396 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Mitf-208ENSMUST00000203938 1074 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm18258-201ENSMUST00000210413 542 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 AC138284.2-201ENSMUST00000213982 567 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 AC163651.2-202ENSMUST00000222628 1192 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 AC132112.1-201ENSMUST00000226354 505 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm10491-201ENSMUST00000085330 117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Cd59b-201ENSMUST00000090429 796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 8430419K02Rik-201ENSMUST00000128654 1870 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Ceacam3-201ENSMUST00000108491 3261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Pirb-201ENSMUST00000078451 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Nfatc3-206ENSMUST00000212742 3207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Dach2-204ENSMUST00000113380 2894 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Gm45697-201ENSMUST00000212893 2876 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r100-201ENSMUST00000166081 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
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