Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Cnot2-213ENSMUST00000169921 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm43490-201ENSMUST00000197593 2652 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm16185-201ENSMUST00000125071 3207 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm40909-202ENSMUST00000223275 5564 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 A530083M17Rik-201ENSMUST00000199877 3376 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm14711-201ENSMUST00000117056 217 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm8424-201ENSMUST00000117716 988 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm12256-201ENSMUST00000132394 446 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Glipr1-204ENSMUST00000162508 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 I0C0044D17Rik-202ENSMUST00000168045 510 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Vdac2-208ENSMUST00000172727 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm26907-201ENSMUST00000181794 729 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Mir6911-201ENSMUST00000184241 69 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 AV026068-202ENSMUST00000185793 486 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 1700031M16Rik-204ENSMUST00000189724 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 1700031M16Rik-207ENSMUST00000191513 847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm37386-201ENSMUST00000194755 72 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Snhg1-211ENSMUST00000206155 605 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Olfr663-201ENSMUST00000209914 959 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 AC164087.1-201ENSMUST00000215174 733 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm5176-201ENSMUST00000218244 1227 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Olfr151-202ENSMUST00000221099 929 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm6474-201ENSMUST00000223250 699 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 AV026068-231ENSMUST00000225862 482 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Vmn1r16-201ENSMUST00000227168 912 ntAPPRIS P2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 AC154627.3-201ENSMUST00000228441 334 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 1110012L19Rik-201ENSMUST00000053981 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Olfr1257-201ENSMUST00000060795 1016 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm4963-201ENSMUST00000072718 378 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm24207-201ENSMUST00000082781 108 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm26330-201ENSMUST00000082817 104 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Trim23-202ENSMUST00000069174 4258 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm44894-201ENSMUST00000205280 2174 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Olfr947-ps1-201ENSMUST00000214075 2165 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Cnga1-205ENSMUST00000201463 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm7697-201ENSMUST00000201500 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Lrrn3-201ENSMUST00000043884 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm10441-201ENSMUST00000200950 1546 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Olfr1118-202ENSMUST00000216396 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Lair1-201ENSMUST00000068865 6828 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm37180-201ENSMUST00000195335 2819 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Ccna2-205ENSMUST00000196316 2001 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm6645-201ENSMUST00000118505 2726 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm28240-201ENSMUST00000187560 2053 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Zfp738-203ENSMUST00000137496 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Aspn-201ENSMUST00000021820 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Matr3-201ENSMUST00000166793 6262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Pfpl-201ENSMUST00000168148 3918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 5430403G16Rik-201ENSMUST00000092720 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Tcrg-V3-201ENSMUST00000103559 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Mir466j-201ENSMUST00000116876 122 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Fpr2-202ENSMUST00000149944 883 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm11507-201ENSMUST00000156462 412 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm22261-201ENSMUST00000158691 324 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm27255-201ENSMUST00000184303 529 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm27818-201ENSMUST00000184536 159 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm18348-201ENSMUST00000191227 820 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm37760-201ENSMUST00000194726 3841 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 1700126G02Rik-201ENSMUST00000204351 725 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Tas2r145-ps3-201ENSMUST00000204526 992 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm44048-201ENSMUST00000204531 361 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm15839-202ENSMUST00000211219 664 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 AC151971.3-201ENSMUST00000214694 404 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Olfr720-203ENSMUST00000216079 4692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm18904-201ENSMUST00000218756 329 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 AC164624.1-201ENSMUST00000219148 1025 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 AC156950.1-201ENSMUST00000219604 456 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 AC153840.1-201ENSMUST00000219685 313 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 AC124356.2-201ENSMUST00000221874 336 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 AL671874.1-201ENSMUST00000223746 1123 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 CT030238.1-201ENSMUST00000228393 442 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Clec2j-201ENSMUST00000032517 515 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Adam7-201ENSMUST00000022640 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Olfr378-201ENSMUST00000069790 1508 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Sptssb-201ENSMUST00000051239 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Vmn1r27-203ENSMUST00000228530 3115 ntAPPRIS P2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Cyp4a31-202ENSMUST00000030486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gab3-203ENSMUST00000114109 2093 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm28710-202ENSMUST00000211738 2987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Glb1l3-201ENSMUST00000034448 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Olfr808-202ENSMUST00000203236 4523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm37789-201ENSMUST00000192862 2889 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 3110043O21Rik-202ENSMUST00000108126 2644 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Ceacam5-201ENSMUST00000081907 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Ago2-201ENSMUST00000044113 13705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Gm46430-206ENSMUST00000222064 1647 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Olfr390-204ENSMUST00000215161 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Ccdc47Q9D024 Adam28-201ENSMUST00000022642 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm23274-201ENSMUST00000104056 130 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm11912-201ENSMUST00000117235 264 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm13537-201ENSMUST00000120467 267 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 n-R5s24-201ENSMUST00000122518 117 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm14093-201ENSMUST00000145579 364 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Nr6a1os-202ENSMUST00000151229 525 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Gm15810-201ENSMUST00000160241 681 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 4930556I23Rik-201ENSMUST00000160659 560 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc47Q9D024 Ear-ps9-201ENSMUST00000161963 460 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms