Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBW7

Chic1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chic1Q8CBW7 Tns3-201ENSMUST00000020695 7483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Zscan4-ps1-201ENSMUST00000165848 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Gm17259-201ENSMUST00000181520 4608 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Vmn1r34-207ENSMUST00000228647 2979 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Gm45237-202ENSMUST00000211157 2452 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 2310001H17Rik-202ENSMUST00000181238 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Clcn7-201ENSMUST00000040729 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Ncapd3-202ENSMUST00000086198 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Gria3-209ENSMUST00000165288 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Fut10-203ENSMUST00000161502 3527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Extl2-201ENSMUST00000029575 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Nbr1-204ENSMUST00000107208 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Mapk10-206ENSMUST00000133069 2732 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Gm37730-201ENSMUST00000192432 2211 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Nup133-201ENSMUST00000044795 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Dysf-215ENSMUST00000204591 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Gm11925-201ENSMUST00000121375 535 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Gm25058-201ENSMUST00000157365 128 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Gm26351-201ENSMUST00000157532 232 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Gm25655-201ENSMUST00000158465 290 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 1700121L16Rik-201ENSMUST00000189166 561 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Gm29348-201ENSMUST00000189555 779 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Gm43449-201ENSMUST00000202955 371 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Gm45666-201ENSMUST00000211474 277 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 AC132304.1-201ENSMUST00000218860 135 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 CT571266.1-201ENSMUST00000222859 153 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Ly6a-201ENSMUST00000023248 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Guca2a-201ENSMUST00000024015 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 mt-Tt-201ENSMUST00000082422 67 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Csnk1g1-209ENSMUST00000205379 4001 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Ogdhl-201ENSMUST00000022480 3449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Htr2c-201ENSMUST00000036303 4747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Gm14806-201ENSMUST00000116606 2110 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Olfr1065-202ENSMUST00000216162 2148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Gm26903-201ENSMUST00000180749 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Eaf2-202ENSMUST00000075946 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Phactr4-203ENSMUST00000102568 4614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Galk2-201ENSMUST00000028636 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Zfp354a-203ENSMUST00000109119 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Gm4894-202ENSMUST00000216428 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Eny2-201ENSMUST00000060652 3000 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Mcmdc2-205ENSMUST00000171802 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Actr2-201ENSMUST00000000137 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Gm14037-201ENSMUST00000120576 313 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Anp32b-ps1-201ENSMUST00000122215 758 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Rpl21-ps8-201ENSMUST00000130005 478 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Gm11967-201ENSMUST00000135132 480 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Scml1-201ENSMUST00000136860 576 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Cldn34-ps-201ENSMUST00000145498 600 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Mir21b-201ENSMUST00000184317 108 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Gm28894-201ENSMUST00000185214 615 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Gm29320-201ENSMUST00000185235 615 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Gm29048-201ENSMUST00000185342 615 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Gm29403-201ENSMUST00000185491 615 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Gm28471-201ENSMUST00000185994 615 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Gm28248-201ENSMUST00000186093 615 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Gm29179-202ENSMUST00000186138 615 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Gm28943-201ENSMUST00000186187 615 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Gm28736-201ENSMUST00000186257 615 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Gm28261-201ENSMUST00000186417 615 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Gm28598-201ENSMUST00000186490 615 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Gm28057-201ENSMUST00000186603 615 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Gm29448-201ENSMUST00000186675 615 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Gm28983-201ENSMUST00000186685 614 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Gm29401-201ENSMUST00000186690 615 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Gm28815-201ENSMUST00000186751 615 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Gm29178-204ENSMUST00000186784 615 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Gm29314-201ENSMUST00000186800 615 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Gm28608-201ENSMUST00000186860 615 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Gm28589-201ENSMUST00000186991 615 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Gm28936-201ENSMUST00000187153 615 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Gm29121-201ENSMUST00000187611 615 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Gm28106-201ENSMUST00000187640 615 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Gm28243-201ENSMUST00000187801 615 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Gm28253-202ENSMUST00000187971 615 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Gm28844-202ENSMUST00000187977 615 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Gm29476-201ENSMUST00000188397 615 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Gm29505-201ENSMUST00000188424 615 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Gm28125-201ENSMUST00000188470 615 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Gm28468-201ENSMUST00000188536 615 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Gm29391-201ENSMUST00000188545 615 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Gm29280-201ENSMUST00000188571 615 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Gm28349-201ENSMUST00000188590 615 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Gm29268-201ENSMUST00000188669 615 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Gm28213-201ENSMUST00000189183 615 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Gm29058-201ENSMUST00000189510 615 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Gm29377-205ENSMUST00000189603 615 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Gm28327-201ENSMUST00000189638 615 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Gm28790-201ENSMUST00000189642 615 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Gm28907-201ENSMUST00000189700 615 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Gm29169-201ENSMUST00000189835 615 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Gm28193-201ENSMUST00000189863 615 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Gm29115-201ENSMUST00000189870 615 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Gm29624-201ENSMUST00000190018 615 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Gm28366-201ENSMUST00000190147 615 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Gm28769-201ENSMUST00000190176 615 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Gm28780-201ENSMUST00000190223 615 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Chic1Q8CBW7 Gm28162-201ENSMUST00000190545 615 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms