Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprtQ99M80 Il13ra2-202ENSMUST00000112827 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PtprtQ99M80 Gm4166-201ENSMUST00000220893 2996 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
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PtprtQ99M80 Brca1-201ENSMUST00000017290 6572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PtprtQ99M80 Cdh9-202ENSMUST00000228307 3539 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PtprtQ99M80 Gm6162-201ENSMUST00000194870 2930 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PtprtQ99M80 Olfr1038-ps-202ENSMUST00000216665 4530 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PtprtQ99M80 Cd86-201ENSMUST00000089620 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PtprtQ99M80 Gm11833-201ENSMUST00000118393 853 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PtprtQ99M80 Gm6031-201ENSMUST00000121314 1054 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PtprtQ99M80 Gm22588-201ENSMUST00000157510 140 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PtprtQ99M80 Gm24505-201ENSMUST00000157682 126 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
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