Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm3194-202ENSMUST00000180867 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 AC153494.1-201ENSMUST00000218664 3041 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Wdr64-202ENSMUST00000171939 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Olfr1166-201ENSMUST00000099833 1628 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Vps50-202ENSMUST00000164052 4824 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 4930421C12Rik-201ENSMUST00000200814 1574 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Gcnt1-201ENSMUST00000169897 4594 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Gm7416-201ENSMUST00000117448 1487 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Gm28183-201ENSMUST00000191321 1406 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Gm42662-201ENSMUST00000202539 1431 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Ceacam5-201ENSMUST00000081907 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 2700099C18Rik-204ENSMUST00000183133 1333 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Vmn1r71-210ENSMUST00000228561 4747 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Gm23608-201ENSMUST00000104545 128 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Olfr800-201ENSMUST00000104903 940 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Smpx-202ENSMUST00000112520 503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Gm11802-201ENSMUST00000137749 653 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Gm23906-201ENSMUST00000157573 128 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Gm22916-201ENSMUST00000157616 119 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Vmn1r101-201ENSMUST00000164245 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Vmn1r119-201ENSMUST00000164683 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Vmn1r149-201ENSMUST00000165916 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Gm4187-201ENSMUST00000172551 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Gm4133-201ENSMUST00000172989 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Mir6391-201ENSMUST00000184391 104 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Gm20561-201ENSMUST00000188131 292 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Gm28468-201ENSMUST00000188536 615 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Gm18382-201ENSMUST00000194394 582 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Gm2623-201ENSMUST00000199229 286 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Gm20997-201ENSMUST00000205148 231 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Olfr540-ps1-201ENSMUST00000210499 612 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 AC154472.2-201ENSMUST00000221186 288 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 3830408C21Rik-204ENSMUST00000224838 714 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Defb35-201ENSMUST00000076786 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Vmn1r31-203ENSMUST00000177318 2076 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Prr14l-201ENSMUST00000120129 9959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Atf2-204ENSMUST00000112007 4195 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Zfp950-207ENSMUST00000180544 2568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Foxr2-201ENSMUST00000096265 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Naip2-203ENSMUST00000167986 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Ptprj-202ENSMUST00000111495 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Gm33378-201ENSMUST00000219831 2758 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Cnot2-213ENSMUST00000169921 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Vmn1r39-206ENSMUST00000228651 2144 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Gm14857-201ENSMUST00000117862 3185 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Vmn2r116-201ENSMUST00000164856 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Gm9239-201ENSMUST00000186942 2557 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Gp6-202ENSMUST00000206928 5900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Gm38253-201ENSMUST00000194058 4678 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Olfr934-203ENSMUST00000216823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Gm5039-202ENSMUST00000218054 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Aak1-202ENSMUST00000089519 19341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Dlg1-204ENSMUST00000115196 3418 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Kmt2d-201ENSMUST00000023741 19823 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Tead1-202ENSMUST00000069256 9480 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Gm14011-201ENSMUST00000145178 302 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 4430402I18Rik-203ENSMUST00000160542 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Mir6907-201ENSMUST00000183764 71 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Mir1957b-201ENSMUST00000184608 123 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 1700060O08Rik-201ENSMUST00000185390 281 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Mrgprb9-ps-201ENSMUST00000188739 892 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Gm42776-201ENSMUST00000198031 406 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Gm6051-201ENSMUST00000201529 352 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 1700126G02Rik-201ENSMUST00000204351 725 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
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Hoxd10P28359 Olfr266-202ENSMUST00000213616 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Gm3604-201ENSMUST00000107989 1677 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Gm26535-201ENSMUST00000181602 2600 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Vmn2r79-201ENSMUST00000164462 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Gm42905-201ENSMUST00000196237 1611 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd10P28359 Gabrp-201ENSMUST00000020366 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Hoxd10P28359 Kif20b-203ENSMUST00000223907 5423 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Hoxd10P28359 Gm37101-201ENSMUST00000191656 3660 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Hoxd10P28359 Gm37762-201ENSMUST00000194515 3561 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd10P28359 Pus10-201ENSMUST00000020520 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd10P28359 Clk1-201ENSMUST00000034868 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd10P28359 Olfr328-204ENSMUST00000216725 2904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd10P28359 Tbc1d32-201ENSMUST00000099739 7240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd10P28359 Rpl23a-201ENSMUST00000102483 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd10P28359 Gm14606-201ENSMUST00000117078 1155 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd10P28359 Gm14304-201ENSMUST00000117272 446 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd10P28359 Gm12520-201ENSMUST00000117493 316 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd10P28359 Mageb16-ps1-201ENSMUST00000117991 1127 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd10P28359 Gm14930-201ENSMUST00000118864 652 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd10P28359 2610024D14Rik-201ENSMUST00000121233 294 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd10P28359 Astx4d-201ENSMUST00000123136 1149 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd10P28359 Astx3-201ENSMUST00000123508 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd10P28359 Gm15589-201ENSMUST00000144193 271 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd10P28359 B230216N24Rik-204ENSMUST00000161661 719 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd10P28359 Gm17081-201ENSMUST00000167363 478 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd10P28359 Rpl9-ps5-201ENSMUST00000174221 571 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 151.9 ms