Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Cyld-203ENSMUST00000109626 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 Adgrf2-201ENSMUST00000113614 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 Olfr807-202ENSMUST00000213379 1866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 Olfr156-204ENSMUST00000215406 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 D7Bwg0826e-201ENSMUST00000208484 3795 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 Mgat4a-205ENSMUST00000151952 7251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 Fam227b-204ENSMUST00000178118 1599 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 Kcnmb2-204ENSMUST00000191869 1552 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 AC124446.1-201ENSMUST00000221027 2644 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 Kcnma1-210ENSMUST00000179836 3177 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 Akr1c19-202ENSMUST00000118663 5832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 Slc5a4b-201ENSMUST00000120757 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 Gm6093-202ENSMUST00000222963 2163 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 Tenm4-202ENSMUST00000107165 10930 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 Gm42609-201ENSMUST00000196362 3306 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 Tmem209-202ENSMUST00000102991 1718 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 AI987944-204ENSMUST00000206801 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 Cebpz-201ENSMUST00000024885 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 Acox3-210ENSMUST00000202266 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 Tgm3-201ENSMUST00000110299 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 Dlgap5-201ENSMUST00000043296 2964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 Pcmtd2-201ENSMUST00000029116 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 Cflar-205ENSMUST00000114313 6572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 Igkv17-127-201ENSMUST00000103309 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 Gm13486-201ENSMUST00000119910 282 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 Gm15007-201ENSMUST00000119982 710 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 Gm16224-201ENSMUST00000127711 412 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 Cfap61-212ENSMUST00000152515 640 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 Gm25223-201ENSMUST00000158200 110 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 Gm21834-201ENSMUST00000178907 453 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 Gm25617-201ENSMUST00000179548 133 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 Gm26970-201ENSMUST00000182990 964 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 Gm28289-201ENSMUST00000189331 315 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 Gm18797-201ENSMUST00000190809 1174 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 Gm32340-201ENSMUST00000192883 259 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 Ass-ps1-201ENSMUST00000197717 761 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 Gm25617-202ENSMUST00000198387 132 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 Gm4525-201ENSMUST00000198831 254 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 Gm19708-201ENSMUST00000199386 543 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 Tgif1-ps-201ENSMUST00000201864 736 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 Gm45216-201ENSMUST00000205547 600 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 Gm45002-201ENSMUST00000208045 120 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 Gm7675-201ENSMUST00000208828 686 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 Gm45478-201ENSMUST00000209472 211 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 Gm35890-201ENSMUST00000221195 564 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 Klhl13-202ENSMUST00000115313 3251 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 C5ar2-201ENSMUST00000098792 3429 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 Calb1-201ENSMUST00000029876 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 Itgb6-203ENSMUST00000112517 3537 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 Gm43282-201ENSMUST00000201848 2157 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 Cxcr1-202ENSMUST00000190313 1451 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 2900027M19Rik-201ENSMUST00000207411 4448 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 Idh1-203ENSMUST00000169032 2283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 Olfr1289-201ENSMUST00000120021 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 Tdrkh-204ENSMUST00000196606 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 Meis2-205ENSMUST00000110907 3718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 5530400K19Rik-201ENSMUST00000193511 1916 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 Serpinb9f-201ENSMUST00000075515 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 Gm26748-201ENSMUST00000180406 2972 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 4930511E03Rik-201ENSMUST00000203778 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 Gm10822-201ENSMUST00000181596 2320 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 AC129308.1-201ENSMUST00000223800 2309 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 BB031773-201ENSMUST00000148892 3655 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 Grik1-202ENSMUST00000072256 3655 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 Dync1i2-204ENSMUST00000112138 2466 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 Pcdhb3-201ENSMUST00000051754 3787 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 Igkv14-126-201ENSMUST00000103310 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 Ctps2-203ENSMUST00000112300 741 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 Olfr587-ps1-201ENSMUST00000118378 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 Gm16423-201ENSMUST00000120078 947 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 Il18-202ENSMUST00000180021 702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 Olr1-204ENSMUST00000183258 468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 Gm19641-201ENSMUST00000188432 417 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 Igkv13-78-1-201ENSMUST00000199298 200 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 Gm10043-201ENSMUST00000210691 235 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 Gm20163-201ENSMUST00000212232 494 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 Il18-201ENSMUST00000059081 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 Fam24a-201ENSMUST00000084505 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sox12Q04890 Prdm14-201ENSMUST00000047577 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 Gm3822-201ENSMUST00000201941 2935 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 Msh4-205ENSMUST00000190449 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 Fam205c-201ENSMUST00000055944 1655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 Gm5930-201ENSMUST00000111863 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 Olfr869-201ENSMUST00000213024 1783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 Hipk3-203ENSMUST00000111125 3651 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 AI429214-201ENSMUST00000098825 1930 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 Synj2-206ENSMUST00000115787 4013 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 Gm36737-201ENSMUST00000209653 2189 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 Mybbp1a-201ENSMUST00000045633 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 Ncor1-201ENSMUST00000018645 9037 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 Cep85l-204ENSMUST00000220376 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 Cyp2b19-201ENSMUST00000077855 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 Morc1-201ENSMUST00000023330 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 Sema6a-201ENSMUST00000019791 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 Sema5a-201ENSMUST00000067458 10809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 Trim2-202ENSMUST00000065380 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 Dusp18-201ENSMUST00000055931 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 Krtap9-5-201ENSMUST00000105052 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 Gm12255-201ENSMUST00000117184 284 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Sox12Q04890 Gm13733-201ENSMUST00000117290 535 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms