Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Gm42428-201ENSMUST00000198677 302 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn18P56857 Gm42824-201ENSMUST00000199361 247 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn18P56857 Gm5418-201ENSMUST00000206932 528 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn18P56857 Gm17992-201ENSMUST00000207346 1072 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn18P56857 Gm45615-201ENSMUST00000210417 656 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn18P56857 AC153954.2-201ENSMUST00000213811 287 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn18P56857 Gm31698-202ENSMUST00000214385 527 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn18P56857 AC164624.1-201ENSMUST00000219148 1025 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn18P56857 Zfp429-203ENSMUST00000224684 524 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn18P56857 Cox6b2-201ENSMUST00000063324 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn18P56857 Tas2r109-201ENSMUST00000067539 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn18P56857 Olfr345-201ENSMUST00000076850 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn18P56857 Vmn1r175-202ENSMUST00000228383 2878 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn18P56857 Olfr1026-203ENSMUST00000219615 1465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn18P56857 Mier1-202ENSMUST00000097945 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn18P56857 St18-210ENSMUST00000150761 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn18P56857 Gm36963-201ENSMUST00000193506 2324 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cldn18P56857 F630028O10Rik-201ENSMUST00000133125 2771 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cldn18P56857 Gm10635-201ENSMUST00000217201 3721 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cldn18P56857 Olfr49-202ENSMUST00000216214 5717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cldn18P56857 Gm23274-201ENSMUST00000104056 130 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Cldn18P56857 Gm25418-201ENSMUST00000104214 129 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Cldn18P56857 Olfr1196-201ENSMUST00000104892 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cldn18P56857 Vmn1r124-201ENSMUST00000105200 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cldn18P56857 Gm6645-201ENSMUST00000118505 2726 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Cldn18P56857 Gm13503-201ENSMUST00000119017 446 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Cldn18P56857 n-R5s30-201ENSMUST00000122624 122 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Cldn18P56857 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cldn18P56857 Olfr387-ps1-201ENSMUST00000134773 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cldn18P56857 Olfr762-ps1-201ENSMUST00000172948 927 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Cldn18P56857 Gm21761-202ENSMUST00000187530 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cldn18P56857 Gm28962-201ENSMUST00000187993 621 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cldn18P56857 Gm28468-201ENSMUST00000188536 615 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Cldn18P56857 Gm29293-201ENSMUST00000189416 2188 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Cldn18P56857 Gm28692-202ENSMUST00000189645 621 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cldn18P56857 Gm37610-201ENSMUST00000191867 620 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cldn18P56857 Gm9134-201ENSMUST00000193186 551 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Cldn18P56857 Ccna2-205ENSMUST00000196316 2001 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cldn18P56857 Gm42912-201ENSMUST00000197195 716 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cldn18P56857 Gm43130-201ENSMUST00000197721 3907 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Cldn18P56857 Gm7721-201ENSMUST00000200446 546 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Cldn18P56857 A530053G22Rik-203ENSMUST00000204370 612 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cldn18P56857 Gm18007-201ENSMUST00000205019 844 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Cldn18P56857 Abca15-204ENSMUST00000207220 567 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cldn18P56857 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Cldn18P56857 Gm45789-201ENSMUST00000213038 364 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Cldn18P56857 AC164087.1-201ENSMUST00000215174 733 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cldn18P56857 Olfr726-208ENSMUST00000217422 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cldn18P56857 Olfr1200-202ENSMUST00000217588 4996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cldn18P56857 Gm20368-201ENSMUST00000220716 301 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Cldn18P56857 AC157515.1-201ENSMUST00000220953 450 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Cldn18P56857 Olfr151-202ENSMUST00000221099 929 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Cldn18P56857 Prl3d1-202ENSMUST00000225330 866 ntAPPRIS P2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cldn18P56857 Vmn1r54-201ENSMUST00000058039 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cldn18P56857 Trappc1-201ENSMUST00000060956 628 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cldn18P56857 Ang5-201ENSMUST00000066719 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cldn18P56857 Olfr739-201ENSMUST00000075261 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cldn18P56857 Gm23514-201ENSMUST00000082827 130 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Cldn18P56857 Olfr1197-201ENSMUST00000099815 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cldn18P56857 Olfr1328-202ENSMUST00000215312 5038 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Taok1-201ENSMUST00000017435 11813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Olfr1152-202ENSMUST00000213308 6201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Abcg3-201ENSMUST00000031239 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Zfy1-202ENSMUST00000189888 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Gm3985-201ENSMUST00000132101 2515 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 CT025710.1-201ENSMUST00000222949 2533 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Cdh7-208ENSMUST00000146282 4776 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Olfr107-204ENSMUST00000215974 2282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Gm5844-201ENSMUST00000119417 2191 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Olfr1262-202ENSMUST00000111508 6068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Gm15737-201ENSMUST00000113434 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Cyp2c50-201ENSMUST00000068094 1643 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Cenpj-201ENSMUST00000065302 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Gm28183-201ENSMUST00000191321 1406 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Rtl9-201ENSMUST00000165829 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 A330087D11Rik-201ENSMUST00000187265 1334 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Ktn1-219ENSMUST00000190182 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Svs3a-202ENSMUST00000109370 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Gm16149-201ENSMUST00000117631 309 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Gm11550-201ENSMUST00000118210 699 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Gm15828-201ENSMUST00000119911 522 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Gm14135-201ENSMUST00000135438 591 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 4930563I02Rik-202ENSMUST00000154835 971 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Gm11846-201ENSMUST00000155156 515 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Gm21973-201ENSMUST00000157020 358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Gm25389-201ENSMUST00000157340 286 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Gm25846-201ENSMUST00000158013 135 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Gm22725-201ENSMUST00000158092 110 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Vmn1r-ps45-201ENSMUST00000174106 955 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Gm20528-202ENSMUST00000174821 802 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Gm6717-201ENSMUST00000185549 838 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 4930598F16Rik-201ENSMUST00000187352 761 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Gm29664-201ENSMUST00000191125 463 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 9430092D12Rik-201ENSMUST00000194937 1274 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Gm43895-201ENSMUST00000203219 855 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 Gm45845-201ENSMUST00000207326 582 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 4930558N11Rik-203ENSMUST00000211456 1180 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 AC138284.5-201ENSMUST00000214389 652 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Cldn18P56857 CT954323.2-201ENSMUST00000222056 213 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms