Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Dpp10-202ENSMUST00000112606 15297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp455-201ENSMUST00000117110 2556 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdpk1Q9Z2A0 Gm10310-202ENSMUST00000213667 4661 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr1273-ps-201ENSMUST00000214356 4698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdpk1Q9Z2A0 Cdc27-201ENSMUST00000093923 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdpk1Q9Z2A0 Smarca2-203ENSMUST00000112637 1962 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdpk1Q9Z2A0 Gm33843-201ENSMUST00000219313 1637 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdpk1Q9Z2A0 Ighv1-39-201ENSMUST00000103515 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdpk1Q9Z2A0 Gm12193-201ENSMUST00000117250 379 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr1159-ps1-201ENSMUST00000117651 913 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdpk1Q9Z2A0 Gm14529-201ENSMUST00000117894 406 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdpk1Q9Z2A0 Gm14842-201ENSMUST00000119577 269 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15030-201ENSMUST00000119804 484 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11759-201ENSMUST00000121742 464 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15840-201ENSMUST00000122099 943 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdpk1Q9Z2A0 Tctex1d1-203ENSMUST00000125417 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdpk1Q9Z2A0 Saxo1os-201ENSMUST00000131790 628 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdpk1Q9Z2A0 1700047A11Rik-201ENSMUST00000144750 427 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdpk1Q9Z2A0 Gm14742-201ENSMUST00000148284 381 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdpk1Q9Z2A0 Gm22794-201ENSMUST00000157228 306 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdpk1Q9Z2A0 Gm24687-201ENSMUST00000157758 241 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdpk1Q9Z2A0 Gm23050-201ENSMUST00000158775 165 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdpk1Q9Z2A0 Hsd11b1-203ENSMUST00000160929 1256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdpk1Q9Z2A0 4930558K02Rik-202ENSMUST00000162676 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdpk1Q9Z2A0 Gm18604-201ENSMUST00000172535 558 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdpk1Q9Z2A0 Gm22655-201ENSMUST00000174949 96 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdpk1Q9Z2A0 Mirt2-201ENSMUST00000175179 285 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26057-201ENSMUST00000178099 165 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdpk1Q9Z2A0 Gm24969-201ENSMUST00000180331 79 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdpk1Q9Z2A0 1700040F17Rik-201ENSMUST00000187158 817 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdpk1Q9Z2A0 Gm29467-202ENSMUST00000189669 935 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdpk1Q9Z2A0 Gm18407-201ENSMUST00000192126 790 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdpk1Q9Z2A0 Gm36999-201ENSMUST00000192756 1046 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdpk1Q9Z2A0 Gm37196-201ENSMUST00000194762 906 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdpk1Q9Z2A0 4930558C23Rik-201ENSMUST00000196239 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdpk1Q9Z2A0 AC157822.1-201ENSMUST00000196643 80 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdpk1Q9Z2A0 Obox4-ps24-201ENSMUST00000197686 540 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdpk1Q9Z2A0 Gm43608-201ENSMUST00000197703 687 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdpk1Q9Z2A0 Gm9057-201ENSMUST00000198791 296 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdpk1Q9Z2A0 Gm43616-201ENSMUST00000199347 409 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdpk1Q9Z2A0 4930528H21Rik-201ENSMUST00000204264 495 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdpk1Q9Z2A0 Api5-ps-201ENSMUST00000206607 577 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdpk1Q9Z2A0 Gm38590-201ENSMUST00000209515 970 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdpk1Q9Z2A0 Gm18789-201ENSMUST00000216115 550 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11427-204ENSMUST00000216233 999 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdpk1Q9Z2A0 AC152414.2-201ENSMUST00000219620 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdpk1Q9Z2A0 Gm17177-202ENSMUST00000222007 990 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdpk1Q9Z2A0 AC125405.1-201ENSMUST00000226406 589 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdpk1Q9Z2A0 CT009515.3-201ENSMUST00000226509 671 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdpk1Q9Z2A0 Vmn1r24-202ENSMUST00000228315 891 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdpk1Q9Z2A0 AC120375.2-202ENSMUST00000228722 397 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdpk1Q9Z2A0 Gm23686-201ENSMUST00000083241 164 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdpk1Q9Z2A0 Gm24029-201ENSMUST00000083928 143 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdpk1Q9Z2A0 Gm1604b-201ENSMUST00000089120 357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdpk1Q9Z2A0 Gm14326-204ENSMUST00000178829 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Pdpk1Q9Z2A0 Gm35066-201ENSMUST00000198898 2074 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Pdpk1Q9Z2A0 Arhgap12-202ENSMUST00000077128 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Pdpk1Q9Z2A0 Timd2-204ENSMUST00000169584 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Pdpk1Q9Z2A0 A330076H08Rik-202ENSMUST00000207694 1836 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Pdpk1Q9Z2A0 Catsperg2-201ENSMUST00000061193 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Pdpk1Q9Z2A0 Vmn2r5-202ENSMUST00000177184 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Pdpk1Q9Z2A0 Gm36936-201ENSMUST00000194508 2749 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Pdpk1Q9Z2A0 Ktn1-225ENSMUST00000191446 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Pdpk1Q9Z2A0 Usp47-202ENSMUST00000210309 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdpk1Q9Z2A0 Gm42598-201ENSMUST00000200110 2437 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdpk1Q9Z2A0 Pramel5-202ENSMUST00000105752 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdpk1Q9Z2A0 Fam205a3-201ENSMUST00000178192 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdpk1Q9Z2A0 Fam205a2-202ENSMUST00000180201 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdpk1Q9Z2A0 Xpo1-204ENSMUST00000109551 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdpk1Q9Z2A0 Gm35842-201ENSMUST00000207859 4464 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdpk1Q9Z2A0 Gm38198-201ENSMUST00000191772 3581 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr739-202ENSMUST00000216949 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr1065-201ENSMUST00000213789 2154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdpk1Q9Z2A0 Cbx5-201ENSMUST00000108813 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdpk1Q9Z2A0 Akap5-202ENSMUST00000154078 6685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdpk1Q9Z2A0 Akap5-201ENSMUST00000095610 6687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr1342-202ENSMUST00000216226 3269 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdpk1Q9Z2A0 Ddx4-201ENSMUST00000075748 2762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdpk1Q9Z2A0 Igkv1-99-201ENSMUST00000103326 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11821-201ENSMUST00000117335 979 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdpk1Q9Z2A0 Gm12520-201ENSMUST00000117493 316 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr407-ps1-201ENSMUST00000117794 866 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdpk1Q9Z2A0 Gm6744-201ENSMUST00000119303 543 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr381-202ENSMUST00000119863 1065 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15388-201ENSMUST00000121578 726 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdpk1Q9Z2A0 4933401B06Rik-201ENSMUST00000139758 1155 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdpk1Q9Z2A0 Rpl28-ps4-201ENSMUST00000170447 377 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdpk1Q9Z2A0 Gm9671-201ENSMUST00000171502 547 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdpk1Q9Z2A0 V1rd19-201ENSMUST00000173571 1157 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdpk1Q9Z2A0 Gm18953-201ENSMUST00000175694 300 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdpk1Q9Z2A0 Gm6472-201ENSMUST00000178147 651 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdpk1Q9Z2A0 Gm22252-201ENSMUST00000179316 79 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdpk1Q9Z2A0 Gm5473-201ENSMUST00000179326 642 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdpk1Q9Z2A0 Gm21399-201ENSMUST00000180210 597 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdpk1Q9Z2A0 Gm27659-201ENSMUST00000183472 98 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdpk1Q9Z2A0 Igkv19-93-201ENSMUST00000183936 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdpk1Q9Z2A0 Snhg14-205ENSMUST00000186345 456 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdpk1Q9Z2A0 Gm29482-201ENSMUST00000187845 230 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdpk1Q9Z2A0 Gm29289-201ENSMUST00000188358 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdpk1Q9Z2A0 Gm28191-201ENSMUST00000189112 211 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.5 ms