Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Gm30211-201ENSMUST00000197227 3078 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Cpne9Q1RLL3 Smgc-201ENSMUST00000088555 2977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Cpne9Q1RLL3 Olfr300-ps1-201ENSMUST00000174262 2395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Cpne9Q1RLL3 AY512915-203ENSMUST00000159937 3650 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
Cpne9Q1RLL3 Wdr17-209ENSMUST00000150488 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
Cpne9Q1RLL3 Atp6v1g3-201ENSMUST00000027643 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
Cpne9Q1RLL3 Ptprd-217ENSMUST00000174023 4530 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Postn-202ENSMUST00000081564 2670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Olfr506-202ENSMUST00000209296 3228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Fam83b-201ENSMUST00000098546 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Gm11867-201ENSMUST00000133363 1909 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Gm5662-201ENSMUST00000101168 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Gm12887-201ENSMUST00000106265 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Gm16149-201ENSMUST00000117631 309 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Smt3h2-ps-201ENSMUST00000121084 285 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Gm22261-201ENSMUST00000158691 324 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Smdt1-202ENSMUST00000159054 294 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Rpl9-ps9-201ENSMUST00000173020 573 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Gm27255-201ENSMUST00000184303 529 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Mir7008-201ENSMUST00000184398 63 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Gm6717-201ENSMUST00000185549 838 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Gm18348-201ENSMUST00000191227 820 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Gm34176-201ENSMUST00000192621 474 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Gm9442-201ENSMUST00000194242 319 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 BX530055.1-201ENSMUST00000197285 122 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Gm43093-201ENSMUST00000202439 1213 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Gm44048-201ENSMUST00000204531 361 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 AC112956.1-201ENSMUST00000213563 492 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 CT030242.3-201ENSMUST00000221231 581 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Olfr1257-201ENSMUST00000060795 1016 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Gm23972-201ENSMUST00000083322 165 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Dctn4-201ENSMUST00000025505 3738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Olfr552-202ENSMUST00000215712 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Pramef6-202ENSMUST00000105767 1967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Olfr1252-203ENSMUST00000216203 3243 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Psg20-201ENSMUST00000076677 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Akap4-202ENSMUST00000115750 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Lpp-202ENSMUST00000078988 15440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Gm29084-201ENSMUST00000185587 1452 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Rbm44-201ENSMUST00000094698 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Serpinb3b-202ENSMUST00000166100 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Trim23-202ENSMUST00000069174 4258 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Rif1-201ENSMUST00000112693 8509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 C130073E24Rik-202ENSMUST00000211313 14112 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Trbv12-1-201ENSMUST00000103267 389 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Gm12245-201ENSMUST00000117266 357 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Hikeshi-203ENSMUST00000117354 297 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Gm6305-201ENSMUST00000121027 1012 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Gm12650-201ENSMUST00000121966 258 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 n-R5s24-201ENSMUST00000122518 117 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Nr6a1os-202ENSMUST00000151229 525 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Gm24860-201ENSMUST00000158457 276 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Glipr1-204ENSMUST00000162508 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Rpl9-ps5-201ENSMUST00000174221 571 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Gm4831-201ENSMUST00000174626 594 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Gm22852-201ENSMUST00000177899 101 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Gm28660-201ENSMUST00000186496 253 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 1700108J01Rik-201ENSMUST00000187423 484 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Ighv1-27-201ENSMUST00000194473 340 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Gm18924-201ENSMUST00000211929 316 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 AC137127.3-201ENSMUST00000213340 349 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Gm30262-201ENSMUST00000219137 791 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Gm7768-201ENSMUST00000222988 597 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Olfr447-201ENSMUST00000055763 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Dnah12-202ENSMUST00000073309 611 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Mir133b-201ENSMUST00000083546 119 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Olfr859-201ENSMUST00000086480 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Zfp850-201ENSMUST00000099111 941 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Scn9a-207ENSMUST00000169900 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Gm42520-201ENSMUST00000199642 1502 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 AC122357.1-201ENSMUST00000221652 1515 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Olfr378-201ENSMUST00000069790 1508 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Mapk10-204ENSMUST00000112848 6761 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Olfr293-202ENSMUST00000214401 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Serpinb5-201ENSMUST00000086701 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Olfr1449-203ENSMUST00000214079 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 AC159326.1-201ENSMUST00000219989 1302 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Stard9-207ENSMUST00000180041 15102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Olfr965-203ENSMUST00000215164 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Gm10352-201ENSMUST00000166474 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Macc1-202ENSMUST00000221866 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Ccr2-204ENSMUST00000171719 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Olfr616-202ENSMUST00000214806 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Zzz3-204ENSMUST00000106103 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Gm43024-201ENSMUST00000196770 4352 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 5830405F06Rik-201ENSMUST00000192753 1755 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 C87499-202ENSMUST00000107142 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Gm14221-201ENSMUST00000109473 340 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Spin2d-201ENSMUST00000114517 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Gm9429-201ENSMUST00000117804 868 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Gm12039-201ENSMUST00000118219 180 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Gm11313-201ENSMUST00000118779 432 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Gm7189-201ENSMUST00000119811 429 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Gm16463-201ENSMUST00000120527 721 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Gm13484-201ENSMUST00000120738 412 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Gm14065-201ENSMUST00000120848 585 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 4930558G05Rik-201ENSMUST00000122848 494 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 Gm11967-201ENSMUST00000135132 480 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Cpne9Q1RLL3 1700061J23Rik-201ENSMUST00000141678 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms