Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 4930590H14Rik-201ENSMUST00000193999 551 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm37062-201ENSMUST00000195028 701 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm43109-201ENSMUST00000198269 753 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Igkv13-74-1-201ENSMUST00000200611 242 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 4930480C01Rik-201ENSMUST00000200913 901 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm36696-201ENSMUST00000205418 438 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm36159-201ENSMUST00000206737 549 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm45485-201ENSMUST00000211229 357 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm45850-201ENSMUST00000212536 338 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm20786-201ENSMUST00000212649 436 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm3442-201ENSMUST00000216808 710 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 AC165349.1-201ENSMUST00000217896 424 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 AC153917.1-201ENSMUST00000218959 856 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 AC110381.1-201ENSMUST00000218987 586 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm5928-201ENSMUST00000221839 466 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 AC155634.2-201ENSMUST00000222001 489 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm19154-201ENSMUST00000223330 940 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 AC192333.6-201ENSMUST00000224565 725 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 CT010498.1-201ENSMUST00000225382 546 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 AC123533.2-201ENSMUST00000228176 375 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Olfr250-201ENSMUST00000052085 996 ntAPPRIS P2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm8724-201ENSMUST00000081668 483 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm23093-201ENSMUST00000083450 102 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Cntrl-204ENSMUST00000113033 1817 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Hibch-201ENSMUST00000044478 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Bmp10-201ENSMUST00000032125 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Zfp317-203ENSMUST00000213725 2354 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 AC129308.2-203ENSMUST00000224109 2385 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 St18-212ENSMUST00000151281 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Olfr845-202ENSMUST00000213344 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm44231-201ENSMUST00000204106 4075 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Bnc2-201ENSMUST00000102820 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm45073-201ENSMUST00000207688 4247 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm12703-201ENSMUST00000145411 2039 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Atp8b5-202ENSMUST00000102953 2609 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Cyp4a10-202ENSMUST00000094886 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Zfp385b-211ENSMUST00000171063 2668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Abca14-201ENSMUST00000084640 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Olfr1513-202ENSMUST00000215147 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Pcdh15-205ENSMUST00000105429 6719 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm29502-201ENSMUST00000185979 3739 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gria3-202ENSMUST00000115103 3081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Psd3-203ENSMUST00000093468 1739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Vmn2r-ps119-201ENSMUST00000177481 2406 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Tpte-201ENSMUST00000077194 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Qsox2-202ENSMUST00000091263 4011 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Papola-215ENSMUST00000170002 2605 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Cep70-201ENSMUST00000093795 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm42653-201ENSMUST00000200644 2839 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Cnga1-202ENSMUST00000126799 2061 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm5935-201ENSMUST00000101667 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm11898-201ENSMUST00000117161 385 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm12242-201ENSMUST00000118824 738 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Clec2f-201ENSMUST00000121051 374 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm12540-201ENSMUST00000121938 319 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Rapgef4os1-201ENSMUST00000126462 638 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 2610204G07Rik-201ENSMUST00000131215 992 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm16098-201ENSMUST00000141926 796 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm11963-201ENSMUST00000149826 500 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 4933407I08Rik-201ENSMUST00000151215 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm13727-201ENSMUST00000154480 424 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm24550-201ENSMUST00000158648 279 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 2310075C17Rik-201ENSMUST00000161216 326 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Ulbp1-201ENSMUST00000169796 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r-ps84-201ENSMUST00000172853 923 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm24155-201ENSMUST00000175259 110 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 1700054K02Rik-201ENSMUST00000181755 376 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm21614-201ENSMUST00000183260 1005 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm5116-201ENSMUST00000187732 463 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm29627-201ENSMUST00000187984 463 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm28583-201ENSMUST00000188903 2141 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm38050-201ENSMUST00000191904 238 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Cfhr2-202ENSMUST00000194186 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm42708-201ENSMUST00000196332 905 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 4930526M16Rik-201ENSMUST00000197305 954 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm45122-201ENSMUST00000206376 784 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm7351-201ENSMUST00000210745 580 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm45857-201ENSMUST00000212207 356 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm3266-201ENSMUST00000217832 591 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 AC132954.1-201ENSMUST00000221017 342 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm36607-201ENSMUST00000222750 1087 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm6575-201ENSMUST00000222946 697 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 AC154467.1-201ENSMUST00000227527 449 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Lalba-201ENSMUST00000023726 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 4930522N08Rik-201ENSMUST00000031274 916 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm22265-201ENSMUST00000082947 116 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Olfr657-201ENSMUST00000098171 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Olfr633-202ENSMUST00000216006 3915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm7451-201ENSMUST00000208382 1392 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm5600-202ENSMUST00000211589 2331 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r11-203ENSMUST00000228235 2376 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 N4bp2-204ENSMUST00000201489 9055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm44220-201ENSMUST00000203784 2487 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r181-208ENSMUST00000228842 4491 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm26806-201ENSMUST00000180403 1519 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Gm35439-201ENSMUST00000200051 4809 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Ate1-208ENSMUST00000216011 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxb2P0C1T1 Sugt1-201ENSMUST00000054908 7392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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